Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF653Q96CK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms