Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLUAP1Q96AJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLUAP1Q96AJ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CLUAP1Q96AJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLUAP1Q96AJ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLUAP1Q96AJ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLUAP1Q96AJ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLUAP1Q96AJ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms