Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFT1Q96AA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFT1Q96AA3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFT1Q96AA3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFT1Q96AA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFT1Q96AA3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFT1Q96AA3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms