Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE3Q969Y0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms