Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP4Q969X6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms