Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF34Q969K3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF34Q969K3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms