Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP7Q93009 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP7Q93009 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP7Q93009 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP7Q93009 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP7Q93009 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP7Q93009 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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