Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms