Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX13Q92968 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms