Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT35Q92764 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT35Q92764 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms