Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRQ92752 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRQ92752 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRQ92752 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRQ92752 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRQ92752 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRQ92752 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRQ92752 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRQ92752 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TNRQ92752 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRQ92752 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRQ92752 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNRQ92752 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRQ92752 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNRQ92752 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNRQ92752 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRQ92752 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRQ92752 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRQ92752 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRQ92752 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRQ92752 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRQ92752 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNRQ92752 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNRQ92752 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNRQ92752 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNRQ92752 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
TNRQ92752 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNRQ92752 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNRQ92752 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNRQ92752 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TNRQ92752 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNRQ92752 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRQ92752 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms