Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX38Q92620 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX38Q92620 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms