Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms