Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATAD2BQ8WXI9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATAD2BQ8WXI9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms