Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ABCA10Q8WWZ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCA10Q8WWZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA10Q8WWZ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCA10Q8WWZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms