Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms