Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms