Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMBR1Q8WVP7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms