Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCTD4Q8WVF5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms