Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK9Q8TD19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
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