Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms