Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELBQ8NG08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELBQ8NG08 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms