Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms