Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC148Q8NFR7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms