Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCPH1Q8NEM0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCPH1Q8NEM0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms