Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4CLQ8ND94 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRN4CLQ8ND94 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4CLQ8ND94 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms