Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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