Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLGALT1Q8NBJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COLGALT1Q8NBJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms