Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC63Q8NA47 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC63Q8NA47 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms