Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms