Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECAB1Q8N987 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECAB1Q8N987 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms