Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM20Q8N5G0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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