Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC71Q8N4P6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC71Q8N4P6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms