Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP1Q8N474 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms