Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LNX2Q8N448 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LNX2Q8N448 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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