Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF2Q8N3S3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms