Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOT2Q8IXI1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms