Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK2Q8IWQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK2Q8IWQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK2Q8IWQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms