Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM50Q86XT4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms