Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC84Q86UT8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms