Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRX1Q86UT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms