Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms