Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms