Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NLRC3Q7RTR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms