Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM5Q71RC9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms