Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms