Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO4C1Q6ZQN7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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