Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD2Q6Y1H2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms