Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD4Q6W3E5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms