Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms